中國科學(xué)院微生物研究所成立于1958年12月3日，其前身是中國科學(xué)院應(yīng)用真菌研究所和中國科學(xué)院北京微生物研究室，目前已發(fā)展成為一個具有雄厚基礎(chǔ)、強大實力和廣泛影響的綜合性微生物學(xué)研究和微生物技術(shù)研發(fā)機構(gòu)。微生物所圍繞“生命與健康”和“資源生態(tài)環(huán)境”創(chuàng)新領(lǐng)域，以微生物資源、微生物技術(shù)、病原微生物與免疫為主要研究領(lǐng)域，在研究微生物生物多樣性、基本生命特征和生態(tài)功能的基礎(chǔ)上，努力創(chuàng)建從微生物資源開發(fā)、功能改造和利用、生物技術(shù)創(chuàng)新到成果轉(zhuǎn)化的自主研發(fā)體系，以服務(wù)國民經(jīng)濟主戰(zhàn)場，服務(wù)國家重大需求，創(chuàng)建世界一流的微生物學(xué)研究中心和微生物技術(shù)研發(fā)基地。