流行性出血熱病毒(EHFV)屬布尼亞病毒科(Bunyaviridae)，漢坦病毒屬(Hantavirus，HV)，現統稱漢坦病毒(HV)。流行性出血熱毒為有膜RNA病毒，形態有圓形，卵圓形和長形三種，病毒核心為基因組RNA和核殼，外層為脂質雙層包膜，表面是糖蛋白，直徑70～210nm。
病毒的基因組、結構蛋白及其功能：漢坦病毒的基因組由L、M和S三個片段組成，S片段編碼病毒核蛋白，核蛋白可誘導機體產生非中和抗體，在免疫保護中起一定作用。M片段編碼病毒膜糖蛋白，包括G1和G2.G1區有抗原決定簇的主要部位，毒力基因可能也在G1區。糖蛋白可能是產生中和抗體、血凝抑制抗體、細胞融合和細胞免疫等的主要功能部位。不同血清型病毒的糖蛋白有差異，血清型不同的病毒其毒力和同一血清型不同毒株的毒力也均不相同，造成了不同血清型病毒在病原學、流行病學，臨床表現等方面有差異的基礎。L片段編碼L蛋白，L蛋白主要是病毒多聚酶(或轉錄酶)蛋白，在病毒復制中起主要作用。
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