研究所成立于1966年2月，由中國科學院地質(zhì)研究所地球化學研究室、昆明地質(zhì)工作站和中科院貴陽化學所等單位合并組成。幾代地化所人開拓進取，努力前進。重視學科建設，在我國建立和發(fā)展了以礦床地球化學、環(huán)境地球化學、第四紀地球化學、天體化學、實驗地球化學、有機地球化學、同位素地球化學、元素地球化學、構(gòu)造地球化學、流體包裹體地球化學為主的地球化學學科體系；重視隊伍建設，是我國首批碩士、博士學位授權(quán)單位和首批博士后流動站建站單位，在所學習和工作的14位科學家先后當選院士；重視實驗室建設，是全國建立了兩個以上國家重點實驗室的少數(shù)科研機構(gòu)之一；重視學術(shù)交流，創(chuàng)建了全國一級學會—中國礦物巖石地球化學學會，為推動全國同行的學術(shù)活動發(fā)揮了重要作用；重視科技創(chuàng)新，取得了包括獲國家科技進步特等獎和國家自然科學一等獎在內(nèi)的一系列重大成果，為地球科學的發(fā)展和國民經(jīng)濟建設做出了重要貢獻。